以美国为首开展的各国“脑计划”不仅仅是探知大脑的基础科研，更涉及各种神经发育疾病、精神类疾病、神经退行性病变的研究和治疗。今年有望启动的“中国大脑计划”更是以“健康脑”为导向。神经性发育或退行性疾病和精神类疾病往往病因不明确，很多目前还得不到有效治疗。但是今年上半年的顶尖杂志CNS上面关于这些疾病的重要进展可谓是在这些患者和患者家庭心中点亮了希望之灯。有意思的是阿尔兹海默症、帕金森综合症和精神分裂症均被证明与免疫系统相关。
自闭症被归类为一种由于神经系统失调导致的发育障碍。目前药物治疗尚无法改变自闭症的病程，也缺乏治疗核心症状的特异性药物。为了更好地研究自闭症，中国科学家在全球首次构建了自闭症猴的模型。Nature上发表的另一篇文章带来了在成人中治疗自闭症的希望。Cell上的文章还发现自闭症不仅仅是大脑的问题。
2016年1月26日，中科院上海生命科学研究院神经科学研究所仇子龙研究组与该研究所苏州非人灵长类研究平台孙强团队在《自然》杂志发表论文，报道了他们成功地构建携带人类自闭症基因MeCP2突变的转基因猴，系全球首次，为深入研究自闭症的病理与探索可能的治疗干预方法提供了重要基础。
在2月25日的Nature中MIT的华人学者Guoping Feng及同事探讨了Shark3基因在小鼠发育中的必须性。揭示了Shank 3表达对神经功能激活后的发展产生深远影响，并表示出在成人患病的大脑中一定程度持续的可塑性。同时也表明自闭症病理的某些方面在成年期也许是可逆转的。
6月9日在线发表在Cell上的一项在小鼠中进行的研究，表明至少某些方面的障碍包括如何触摸感知、焦虑和社会异常与非大脑区域的神经系统缺陷相关。这项工作的一个重要方面是：表明了触觉、感觉功能障碍导致行为障碍，这在以前还没见过。
阿尔茨海默症（AD）是一种起病隐匿的进行性发展的神经系统退行性疾病，俗称老年痴呆。关于治疗阿尔茨海默症方面，Nature和Science都有了激动人心的进展。虽然光遗传学不能用于人类，但研究发现通过激活印迹细胞有望帮助阿尔兹海默症患者找回记忆；阿尔兹海默症的又一致病机制被发现，意味着抑制C1q蛋白过表达，有望成为治疗的新靶标。
在阿尔兹海默症早期阶段，患者通常并不会记起最近所经历的事情。3月16日在线发表在Nature上的一项研究论文中，来自MIT的科学家们表示，这些记忆仍然储存在大脑中，只是患者没有获取的方法而已。这些记忆在帮助之下依然可以被提取出来；尽管目前光遗传学并不能用于人类机体，但本文研究为开发新型疗法来逆转阿尔兹海默氏症患者大脑中的记忆缺失症状提供了新的思路。
Science推翻旧论：免疫细胞“蚕食”神经？阿尔兹海默症的又一致病机制
3月31日，来自于波士顿儿童医院的BethStevens团队在《Science》期刊发表了不一样的结论，呈现出阿尔兹海默症一个潜在的新靶点：痴呆症初期，大脑中正常突触会被接收到错误信号的免疫细胞“蚕食”，从而神经信息被迫阻断，认知能力开始衰退。最新的研究却发现，小神经胶质细胞似乎会在老年斑形成之前，就开始了蚕食突触的过程。这意味着，抑制C1q蛋白过表达，有望成为新靶标。
帕金森综合症特指各种原因造成的以运动迟缓为主的一组临床症候群。帕金森的病因很多，不过Nature今年上半年的一篇文章发现一个点突变居然就会带来帕金森综合症的风险。而就像阿尔兹海默症与免疫细胞相关，帕金森综合症也被证明可能是自体免疫疾病。
最新的研究将α-synuclein基因特定序列的变异和帕金森综合症的风险联系起来，运用基因编辑技术的分析为这种风险提供了可能的解释。这项新的发现在线发表在4月20日的Nature上。这是第一次由基因组关联研究从详细到核苷酸的层面来分析风险的差异——一个突变如何促进疾病发展的风险。
科学家们发现和帕金森综合症相关的两个基因是免疫系统的关键调控因子。这为帕金森氏病可能是自体免疫性疾病提供了直接的证据。相关研究6月23日在线发表在Cell上。免疫系统的攻击可能负责疾病过程中多巴胺神经元的破坏。
这些疾病中最纷繁复杂的莫过于精神分裂症：病因未明、临床症状各异。所以目前精神分裂症病人得到的只是抑制症状的治疗，所以科学家通过6万遗传样本首次解释精神分裂症的生物学根源，希望能够开发出根治疾病的药物。结果出乎意料的是免疫系统同样在大脑的该疾病过程中起了重要作用。
1月27日一项具有里程碑意义的研究在线发表在Nature杂志的网站上：Broad研究所的Stanley精神中心、哈佛医学院和波士顿儿童医院的研究人员根据近6万5千人的遗传分析，揭示了如果一个人继承的“突触修剪”相关的基因(消除神经元之间的连接)，他们的精神分裂症的风险会增加。研究结果是第一次，将这种毁灭性的精神疾病的起源和特定的基因变异与生物过程联系在一起。免疫系统的蛋白质在大脑中起了一个以前没有料到的作用。
对抑郁症的研究结果就更加明晰。Nature的一篇文章揭示了百忧解的药物靶点蛋白结构，另一篇则发现了能快速起效且少副作用的抗抑郁症新药。
百忧解（Prozac又称氟西汀，fluoxetine）及其类似药，在美国是抗抑郁症最常用的处方药。但科学家还不知道它们是如何工作的。现在困惑的一部分：几个广泛使用的抗抑郁症药物靶点的蛋白结构，已经解决了。4月6日在线发表在Nature杂志上关于抗抑郁症药物靶点的蛋白结构，可以使人们开发更好、更有针对性的抑郁症药物。
发表在5月25日的Nature上的一篇研究文章鉴定出了一种潜在的抗抑郁症药物，这种药物可以在几分钟内而不是几个星期缓解抑郁症，而且无氯胺酮严重的副作用或滥用的可能。
